Den fackliga sidan, inklusive Sveriges Farmacevtförbund, har samlats runt kravet på fyra veckors sammanhängande semester under perioden juni till augusti.
Almega avvisar kravet med hänvisning till personalbristen.
Almega vill istället förändra beräkningsmodellen för genomsnittlig veckoarbetstid (läs mer om detaljerna på Sveriges Farmacevtförbunds hemsida).
Detta säger dock facken nej till, eftersom det kan leda till en mer ojämn arbetsbelastning.
– Förhandlingsläget kan beskrivas som låst, säger Martin Lindeblad, förbundets förhandlingschef.
I morgon tisdag inleds slutförhandlingarna, som är planerade att fortsätta till på torsdag.